شناسایی یک cDNA کد کننده ژن Kruppel-like factor 2b (Klf2b) از مخاط پوست ماهی کارپ معمولی (Cyprinus carpio)

نوع مقاله : مقاله کوتاه

نویسندگان

چکیده

پروتئینKruppel-like factors (Klfs)  که وابسته به خانواده پروتئین‌های حاوی دامین zinc-finger می‌باشد، در تنظیم رشد سلول‌های یوکاریوتیک و تفریق انواع متفاوتی از سلول‌های پستانداران نقش دارد. با استفاده از تکنیک RT-PCR یک cDNA کد کننده بخش انتهایی N پروتئین مربوطه به طول 456 نوکلئوتید به کمک پرایمرهای دژنره از مخاط پوست ماهی کارپ معمولی (سیپرینوس کارپیو) افزوده گردید. از توالی این قطعه به عنوان جستجوگر جهت یافتن قطعات cDNA بزرگتر در زمان جستجوی داده‌های Expressed Sequence Tag بانک بین‌المللی ژن استفاده گردید. در نهایت اندازه قطعه افزوده شده به طول 1157 نوکلئوتید تعیین گردید که این قطعه پلی‌پیتیدی به طول 274 اسید آمینه را کد می‌کند. این پلی‌پیتید دارای وزن ملکولی 359/30 کیلو دالتون و نقطه ایزو الکتریک 88/4 می‌باشد. مقایسه توالی اسیدهای آمینه پروتئین Klf2b شناسایی شده از کارپ معمولی با توالی‌های مشابه مربوط به Danio rerio، Tetraodon nigroviridis و Salmo salar به ترتیب 79، 54 و 53 درصد همولوژی را نشان می‌دهد. در حالی که شباهت این پروتئین با Klf مربوط به Xenopus laevis به میزان 50%، Gallus gallus 44% و Mus musculus 30% برآورد گردید.

کلیدواژه‌ها