بررسی مولکولی سیرکوویروس‌های پرندگان در برخی پرندگان غیر-طوطی سان و تشخیص یک سویه جدید سیرکوویروس قناری در یک قطعه کبوتر

نوع مقاله : مقاله کوتاه

نویسندگان

چکیده

پیشینه: سیرکوویروس‌ها، ویروس‌های کوچک، بدون پوشینه و دارای DNA تک رشته‌ای هستند. اطلاعات اندکی در مورد این عوامل در پرنده‌های غیر-طوطی سان وجود دارد. هدف: تلاش شده است تا سیرکوویروس‌ها در پرندگان غیر-طوطی سان شناسایی و مشخص شوند.     روش کار: چهل و پنج نمونه از گونه‌های مختلف غیر-طوطی سان متعلق به هفت راسته پرندگان جمع‌آوری شد. یک واکنش زنجیره‌ای پلیمراز آشیانه‌ای (nested-PCR) برای تشخیص ژن rep سیرکوویروس‌ها استفاده شد. نتایج: دو نوع مختلف سیرکوویروس‌ها در دو نمونه از کبوتر تشخیص داده شد (11/2، 2/18%). به وسیله آنالیز فیلوژنتیک مشخص شد که یکی از سیرکوویروس‌های تشخیص داده شده در زیر گروه A در مجاورت سویه مربوط به لهستان قرار می‌گیرد. جالب اینکه دیگر سیرکوویروس تشخیص داده شده با سیرکوویروس‌های قناری (CaCVs) قرابت داشت. نتیجه‌گیری: علاوه بر تشخیص مولکولی سیرکوویروس کبوتری (PiCV)، این اولین گزارش از ردیابی CaCV در یک کبوتر است. فرضیات ممکن چنین رویدادی مورد بحث قرار گرفت.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


Bassami, MR; Ypelaar, I; Berryman, D; Wilcox, GE and Raidal, SR (2001). Genetic diversity of beak and feather disease virus detected in psittacine species in Australia. Virology. 279: 392-400.
Cságola, A; Lorincz, M; Tombácz, K; Wladár, Z; Kovács, E and Tuboly, T (2012). Genetic diversity of pigeon circovirus in Hungary. Virus Gen., 44: 75-79.
Dayaram, A; Goldstien, S; Zawar-Reza, P; Gomez, C; Harding, JS and Varsani, A (2013). Identification of starling circovirus in an estuarine mollusc (Amphibola crenata) in New Zealand using metagenomic approaches. Genome Announc., 1: e00278-13.
Goldsmith, TL (1995). Documentation of passerine circoviral infection. In Proceedings: Annual Conference of the American Association of Avian Veterinarians. Philadelphia, USA. PP: 349-350.
Haddadmarandi, MR; Madani, SA; Nili, H and Ghorbani, A (2018). Molecular detection and characterization of beak and feather disease virus in psittacine birds in Tehran, Iran. Iran. J. Vet. Res., 19: 22-26.
Halami, MY; Nieper, H; Müller, H and Johne, R (2008). Detection of a novel circovirus in mute swans (Cygnus olor) by using nested broad-spectrum PCR. Virus Res., 132: 208-212.
Hattermann, K; Soike, D; Grund, C and Mankertz, A (2002). A method to diagnose Pigeon circovirus infection in vivo. J. Virol. Methods. 104: 55-58.
Hughes, AL and Piontkivska, H (2008). Nucleotide sequence polymorphism in circoviruses. Infect. Genet. Evol., 8: 130-138.
ICTV Virus Taxonomy (2018). The Online (10th) Report of International Committee on Taxonomy of Viruses. Available at: https://talk.ictvonline.org/ictv-reports/ictv_ online_report.
Johne, R; Fernández-de-Luco, D; Höfle, U and Müller, H (2006). Genome of a novel circovirus of starlings, amplified by multiply primed rolling-circle amplification. J. Gen. Virol., 87: 1189-1195.
Kumar, S; Stecher, G and Tamura, K (2016). MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol., 33: 1870-1874.
Mahzounieh, M; Heidari Khoei, H; Ghasemi Shamsabadi, M and Dastjerdi, A (2014). Detection and phylogenetic characterization of Columbid circoviruses in Chaharmahal va Bakhtiari province, Iran. Avian Pathol., 43: 524-528.
Phenix, KV; Weston, JH; Ypelaar, I; Lavazza, A; Smyth, JA; Todd, D; Wilcox, GE and Raidal, SR (2001). Nucleotide sequence analysis of a novel circovirus of canaries and its relationship to other members of the genus Circovirus of the family Circoviridae. J. Gen. Virol., 82: 2805-2809.
Rampin, T; Manarolla, G; Pisoni, G; Recordati, C and Sironi, G (2006). Circovirus inclusion bodies in intestinal muscle cells of a canary. Avian Pathol., 35: 277-279.
Raue, R; Schmidt, V; Freick, M; Reinhardt, B; Johne, R; Kamphausen, L; Kaleta, EF; Müller, H and Krautwald-Junghanns, ME (2005). A disease complex associated with pigeon circovirus infection, young pigeon disease
syndrome. Avian Pathol., 34: 418-425.
Sarker, S; Moylan, KG; Ghorashi, SA; Forwood, JK; Peters, A and Raidal, SR (2015). Evidence of a deep viral host switch event with beak and feather disease virus infection in rainbow bee-eaters (Merops ornatus). Sci. Rep., 5: 14511.
Soike, D; Hattermann, K; Albrecht, K; Segales, J; Domingo, M; Schmitt, C and Mankertz, A (2001). A diagnostic study on columbid circovirus infection. Avian Pathol., 30: 605-611.
Stenzel, T and Pestka, D (2014). Occurrence and genetic diversity of pigeon circovirus strains in Poland. Acta Vet. Hung., 62: 274-283.
Stenzel, T; Piasecki, T; Chrząstek, K; Julian, L; Muhire, BM; Golden, M; Martin, DP and Varsani, A (2014). Pigeon circoviruses display patterns of recombination, genomic secondary structure and selection similar to those of beak and feather disease viruses. J. Gen. Virol., 95: 1338-1351.
Tamura, K and Nei, M (1993). Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Mol. Biol. Evol., 10: 512-526.
Todd, D (2000). Circoviruses: immunosuppressive threats to avian species: a review. Avian Pathol., 29: 373-394.
Todd, D; Weston, J; Ball, NW; Borghmans, BJ; Smyth, JA; Gelmini, L and Lavazza, A (2001). Nucleotide sequence-based identification of a novel circovirus of canaries. Avian Pathol., 30: 321-325.
Zhang, Z; Dai, W; Wang, S and Dai, D (2015). Epidemiology and genetic characteristics of pigeon circovirus (PiCV) in eastern China. Arch. Virol., 160: 199-206.