ژنوتایپینگ ویروس برونشیت عفونی پرندگان در افغانستان (2016 تا 2017): اولین گزارش

نوع مقاله : مقاله کوتاه

نویسندگان

چکیده

پیشینه: برونشیت عفونی (IB) پرندگان یک بیماری ویروسی بسیار واگیردار است که دارای اثرات اقتصادی بر صنعت طیور می‌باشد. این ویروس دارای ژنوتیپ‌های متفاوتی می‌باشد و برای طبقه‌بندی سویه‌های ویروس برونشیت عفونی (IBV) از تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک استفاده شده است. هدف: تعیین ژنوتیپ‌های ویروس برونشیت عفونی پرندگان در حال چرخش در افغانستان برای اولین بار بوده است. روش کار: نمونه‌های نای از 100 گله مختلف گوشتی تجاری با علایم تنفسی در افغانستان در طی سال‌های 2016 تا 2017 جمع‌آوری شد. بعد از انجام نسخه برداری معکوس-واکنش زنجیره‌ای پلیمراز زمان حقیقی RRT-PCR))، نمونه‌های مثبت مشخص شد. یک بخش ژن گلیکوپروتئین اسپایک bp 390 با استفاده از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز آشیانه‌ای، توالی یابی گردید و مورد بررسی قرار گرفت. نتایج: نتایج RRT-PCR نشان داد که 45 گله از 100 گله ذکر شده مثبت بودند. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک تمام نمونه‌های مثبت نشان داد که سویه‌های ویروس برونشیت عفونی به دو گروه ژنوتیپ متمایز تقسیم می‌شوند: LX4 (GI-19) (9/45) و شبه IS-1494 (34/45) (GI-23). همچنین 2 نمونه از 45 نمونه قابل شناسایی نبودند. نتیجه‌گیری: این اولین مطالعه‌ای است که بر روی اپیدمیولوژی مولکولی ویروس برونشیت عفونی در افغانستان تمرکز دارد و بینش ما از برونشیت عفونی در منطقه را گسترش داده است. این نتایج نشان دهنده میزان بالای عفونت برونشیت عفونی در مزارع طیور گوشتی افغانستان می‌باشد و بر ادامه پایش روی ویروس برونشیت عفونی جهت اصلاح برنامه‌های واکسیناسیون تایید می‌نماید.

کلیدواژه‌ها


Ahmed, Z; Naeem, K and Hameed, A (2007). Detection and seroprevalence of infectious bronchitis virus strains in commercial poultry in Pakistan. Poult. Sci., 86: 1329-1335.
Al-Shekaili, T; Baylis, M and Ganapathy, K (2015). Molecular detection of infectious bronchitis and avian metapneumoviruses in Oman backyard poultry. Res. Vet. Sci., 99: 46-52.
Bozorgmehri-Fard, M; Charkhkar, S and Hosseini, H (2014). Detection of the Chinese genotype of infectious bronchitis virus (QX-type) in Iran. Iran. J. Virol., 7: 21-24.
Callison, SA; Hilt, DA; Boynton, TO; Sample, BF; Robison, R; Swayne, DE and Jackwood, MW (2006). Development and evaluation of a real-time Taqman RT-PCR assay for the detection of infectious bronchitis virus from infected chickens. J. Virol. Methods. 138: 60-65.
De Wit, J; Cook, JK and Van Der Heijden, HM (2011). Infectious bronchitis virus variants: a review of the history, current situation and control measures. Avian Pathol., 40: 223-235.
De Wit, J; Nieuwenhuisen-van Wilgen, J; Hoogkamer, A; Van De Sande, H; Zuidam, G and Fabri, T (2011). Induction of cystic oviducts and protection against early challenge with infectious bronchitis virus serotype D388 (genotype QX) by maternally derived antibodies and by early vaccination. Avian Pathol., 40: 463-471.
Dolz, R; Pujols, J; Ordóñez, G; Porta, R and Majó, N (2006). Antigenic and molecular characterization of isolates of the Italy 02 infectious bronchitis virus genotype. Avian Pathol., 35: 77-85.
Dolz, R; Pujols, J; Ordóñez, G; Porta, R and Majó, N (2008). Molecular epidemiology and evolution of avian infectious bronchitis virus in Spain over a fourteen-year period. Virology. 374: 50-59.
Franzo, G; Massi, P; Tucciarone, CM; Barbieri, I; Tosi, G; Fiorentini, L; Ciccozzi, M; Lavazza, A; Cecchinato, M and Moreno, A (2017). Think globally, act locally: phylodynamic reconstruction of infectious bronchitis virus (IBV) QX genotype (GI-19 lineage) reveals different population dynamics and spreading patterns when evaluated on different epidemiological scales. PloS One. 12: e0184401.
Habibi, M; Karimi, V; Langeroudi, AG; Ghafouri, S; Hashemzadeh, M; Farahani, R; Maghsoudloo, H; Abdollahi, H and Seifouri, P (2017). Combination of H120 and 1/96 avian infectious bronchitis virus vaccine strains protect chickens against challenge with IS/1494/06 (variant 2)-like infectious bronchitis virus. Acta Virol. 61: 150-160.
Hamadan, AM; Ghalyanchilangeroudi, A; Hashemzadeh, M; Hosseini, H; Karimi, V; Yahyaraeyat, R and Najafi, H (2017). Genotyping of avian infectious bronchitis viruses in Iran (2015-2017) reveals domination of IS-1494 like virus. Virus Res., 240: 101-106.
Hosseini, H; Bozorgmehri Fard, MH; Charkhkar, S and Morshed, R (2015). Epidemiology of avian infectious bronchitis virus genotypes in Iran (2010-2014). Avian Dis., 59: 431-435.
Hussein, AH; Emara, M; Rohaim, M; Ganapathy, K and Arafa, A (2014). Sequence analysis of infectious bronchitis virus IS/1494 like strain isolated from broiler chicken co-infected with Newcastle disease virus in Egypt during 2012. Int. J. Poult. Sci., 13: 530-536.
Kahya, S; Coven, F; Temelli, S; Eyigor, A and Carli, KT (2013). Presence of IS/1494/06 genotype-related infectious bronchitis virus in breeder and broiler flocks in Turkey. Ankara Univ. Vet. Fak. Derg., 60: 27-31.
Kumar, S; Stecher, G and Tamura, K (2016). MEGA7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol., 33: 1870-1874.
Lim, TH; Lee, HJ; Lee, DH; Lee, YN; Park, JK; Youn, HN; Kim, MS; Lee, JB; Park, SY and Choi, IS (2011). An emerging recombinant cluster of nephropathogenic strains
of avian infectious bronchitis virus in Korea. Infect. Genet. Evol., 11: 678-685.
Liu, S; Chen, J; Han, Z; Zhang, Q; Shao, Y; Kong, X and Tong, G (2006). Infectious bronchitis virus: S1 gene characteristics of vaccines used in China and efficacy of vaccination against heterologous strains from China. Avian Pathol., 35: 394-399.
Najafi, H; Langeroudi, AG; Hashemzadeh, M; Karimi, V; Madadgar, O; Ghafouri, SA; Maghsoudlo, H and Farahani, RK (2015). Molecular characterization of infectious bronchitis viruses isolated from broiler chicken farms in Iran, 2014-2015. Arch. Virol., 161: 1-10.
Najafi, H; Langeroudi, AG; Hashemzadeh, M; Karimi, V; Madadgar, O; Ghafouri, SA; Maghsoudlo, H and Farahani, RK (2016). Molecular characterization of infectious bronchitis viruses isolated from broiler chicken farms in Iran, 2014-2015. Arch. Virol., 161: 53-62.
Ovchinnikova, EV; Bochkov, YA; Shcherbakova, LO; Nikonova, ZB; Zinyakov, NG; Elatkin, NP; Mudrak, NS; Borisov, AV and Drygin, VV (2011). Molecular characterization of infectious bronchitis virus isolates from Russia and neighbouring countries: identification of intertypic recombination in the S1 gene. Avian Pathol., 40: 507-514.
Seger, W; GhalyanchiLangeroudi, A; Karimi, V; Madadgar, O; Marandi, MV and Hashemzadeh, M (2016). Genotyping of infectious bronchitis viruses from broiler farms in Iraq during 2014-2015. Arch. Virol., 161: 1229-1237.
Valastro, V; Holmes, EC; Britton, P; Fusaro, A; Jackwood, MW; Cattoli, G and Monne, I (2016). S1 gene-based phylogeny of infectious bronchitis virus: an attempt to harmonize virus classification. Infect. Genet. Evol., 39: 349-364.
Worthington, KJ; Currie, R and Jones, RC (2008). A reverse transcriptase-polymerase chain reaction survey of infectious bronchitis virus genotypes in Western Europe from 2002 to 2006. Avian Pathol., 37: 247-257.
Zafar, M (2005). First draft country report on the status and perspectives of the animal genetic resources development and conservation in Islamic Republic of Afghanistan. Kabul, Afghanistan: FAO.
Zhao, W; Gao, M; Xu, Q; Xu, Y; Zhao, Y; Chen, Y; Zhang, T; Wang, Q; Han, Z and Li, H (2017). Origin and evolution of LX4 genotype infectious bronchitis coronavirus in China. Vet. Microbiol., 198: 9-16.