به منظور روشن نمودن ارتباط ژنتیکی میان رده‌های نژاد لیدیا و دو جمعیت اصلی گاوهای لیدیا پرتغالی، کاستا پرتغالی و براوا دوس آکرس، 24 میکروستلایت اتوزومی در 120 نمونه مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. براوا دوس آکرس بالاترین هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار را نشان داد (به ترتیب 73/0 و 70/0) در حالی که کاستا پرتغالی کمترین هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار را نشان داد (به ترتیب 51/0 و 50/0). نتایج این مطالعه با داده‌های میکروستلایتس قبلی از رده‌های اصلی گاوی لیدیا مقایسه شدند. کاستا پرتغالی از لحاظ ژنتیکی بیشترین جمعیت گاو لیدیای جدا شده بود همان طوری که به وسیله میزان فاصله ژنتیکی متوسط FST نسبت به دودمان‌های دیگر (32%) تأیید شد. تمامی جمعیت‌های لیدیا پرتغالی مقادیر FIS منفی داشتند. دندروگرام اتصال به همسایه کاستا پرتغالی را در شاخه مشابهی با میورا گروه‌بندی نمود، که با استفاده از نرم افزار STRUCURE حمایت شد. نتایج سطوح پایین تنوع ژنتیکی و سطوح بالای تمایز ژنتیکی در کاستا پرتغالی و سطوح بالای تنوع ژنتیکی در جمعیت‌های براوا دوس آکرس را احتمالاً ناشی از جفت‌گیری متقاطع رده‌های گاوی مختلف، و جریان ژنتیکی در بین گله‌ها را ثابت کردند.
)