آنالیز توالی ژن VP1 در سه جدایه ایرانی ویروس فوق حاد بیماری بورس عفونی

نوع مقاله : مقاله کامل

نویسندگان

چکیده

بیماری بورس عفونی (IBD) در زمره بیماری‌های بسیار واگیردار ماکیان‌ها می‌باشد که توسط ویروس IBD (IBDV) ایجاد می‌شود. هدف از این مطالعه بررسی خصوصیات سه جدایه ایرانی ویروس فوق حاد IBD بود. با استفاده از RT-PCR، یک قطعه 715 جفت بازی در ژن VP1 سه سویه ایرانی IBDV تکثیر، تعیین توالی، و با سویه‌های IBDV موجود در بانک ژن مورد مقایسه، و ارتباطات فیلوژنتیک آن‌ها مورد بررسی قرار گرفت. در برازش توالی نوکلئوتیدی سویه‌های IBDV، تعداد 23 اختلاف نوکلئوتیدی بین سویه‌های فوق حاد (به جز IL و PT) و بقیه سویه‌های غیر فوق حاد مشاهده شد. تعداد 2 جایگاه نوکلئوتیدی، 863G و 1023A، اختصاصی سویه‌های JRMP07IR و JRMP14IR بودند. همه سویه‌های فوق حاد (به جز IL و PT) در جایگاه‌های اسید آمینه 242E و 287A با سویه‌های غیر فوق حاد متفاوت بودند. در سه سویه ایرانی این مطالعه، جایگاه‌های اسید آمینه 251R در هر دو سویه JRMP07IR و JRMP14IR و 360L در JRMP14IR از بقیه سویه‌های فوق حاد متفاوت بودند. در آنالیز فیلوژنتیک، سه سویه ایرانی در کنار سویه‌های فوق حاد قرار گرفتند. سویه ایرانی، JRMP30IR، به دو سویه اروپایی HOL) و (UK661 و دو سویه جنوب شرق آسیا OKYM) و (ZJ2000، بیشتر نزدیک بود. اما دو سویه دیگر ایرانی، JRMP07IR و JRMP14IR، به دو سویه ترکیه‌ای OA/G1) و (OE/G2 و یک سویه مالزیایی (UPM94) نزدیک‌تر بودند. مطالعات گسترده‌تر در این زمینه دانش بیشتری در خصوص توزیع، تنوع، و ارتباطات فیلوژنتیک سویه‌های IBDV جدا شده در ایران و دیگر نقاط جهان برای پژوهشگران فراهم خواهد نمود.

کلیدواژه‌ها

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار