هدف از مطالعه حاضر تعیین فراوانی ژنوتیپهای کلامیدیا تراکوماتیس در شیراز بوده است. در این مطاله تعداد 212 نمونه اندوسرویکال از زنان مراجعه کننده به درمانگاه مطهری شیراز مورد بررسی قرار گرفت. تشخیص اولیه کلامیدیا تراکوماتیس در این نمونهها با انجام PCR بر روی ژن پلاسمیدی صورت گرفت. ژنوتیپ باکتری در موارد مثبت، با انجام PCR بر روی ناحیه VD1-VD2 ژن omp1 و تعیین توالی آن مشخص گردید. نتایج بیانگر فراوانی کلامیدیا تراکوماتیس به میزان 8% بود. فراوانی ژنوتیپها به ترتیب مربوط به ژنوتیپهای F (6/46%)، E (3/33%) و D (3/13%) بود. ژنوتیپ G تنها در یک نمونه شناسایی گردید. مقایسه توالی نوکلئوتیدی ژنوتیپهای شناسایی شده با توالی سویههای مرجع در GenBank بیانگر وجود تفاوت نوکلئوتیدی در 4 ژنوتیپ بود. یافتههای حاصل از مطالعه حاضر به عنوان بخشی از مطالعات اپیدمیولوژیک به منظور تعیین فراوانی ژنوتیپهای کلامیدیا تراکوماتیس در ایران حائز اهمیت است.