تعیین مشخصات مولکولی متاپنوموویروس پرندگان در حال گردش، تحت گروه B، در جوجه‌های گوشتی، ایران، 1394 تا 1397

نوع مقاله : مقاله کامل

نویسندگان

چکیده

پیشینه: عفونت متاپنوموویروس پرندگان (aMPV) تاثیرات اقتصادی قابل توجهی بر صنعت طیور در سرتاسر جهان دارد. هدف: هدف این مطالعه، بررسی مولکولی انواع تیپ‌های aMPV در مزارع گوشتی استان‌های مختلف ایران از سال 1394 تا 1397 می‌باشد. روش کار: سواب‌های نای و کامی از 200 گله جوجه گوشتی با علائم تنفسی از 10 استان ایران شامل کردستان، آذربایجان غربی، سمنان، اصفهان، سیستان و بلوچستان، قزوین، خوزستان، فارس، گیلان، و خراسان رضوی از بهمن سال 1394 تا دی سال 1397 جمع آوری شدند. پس از استخراج RNA، با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن N وجود aMPV تایید شد. سپس پرایمرهای اختصاصی تحت تیپ برای تمایز دادن تحت تیپ‌های خاص مورد استفاده قرار گرفتند. تمام نمونه‌های مثبت توالی یابی شدند. نتایج: به عنوان یک روند کلی، درصد جوجه‌های مثبت aMPV به مرور زمان افزایش یافت. تمام نمونه‌‌ها با هم دسته بندی شدند و در گروه تحت تیپ B از aMPV قرار گرفتند. اگرچه 2 نمونه از 1394 و 2 نمونه از 1397 در یک شاخه جداگانه قرار گرفتند، اکثریت نمونه‌های مطالعه حاضر از 1394، 1395 و 1397 در شش تحت شاخه جدا شده از هم را نشان دادند و نزدیک به جدایه‌های 1389 و 1391 از ایران قرار گرفتند. نتیجه‌گیری: مطالعه میدانی فعلی نشان دهنده وجود aMPV در تعدادی از مناطق قابل توجهی از ایران است. بنابراین، نقش این ویروس در بیماری‌های تنفسی جوجه‌های گوشتی نباید نادیده گرفته شود.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


Alvarez, R; Lwamba, HM; Kapczynski, DR; Njenga, MK and Seal, BS (2003). Nucleotide and predicted amino acid sequence-based analysis of the avian metapneumovirus type C cell attachment glycoprotein gene: phylogenetic analysis and molecular epidemiology of US pneumoviruses. J. Clin. Microbiol., 41: 1730-1735.
Bäyon-Auboyer, MH; Arnauld, C; Toquin, D and Eterradossi, N (2000). Nucleotide sequences of the F, L and G protein genes of two non-A/non-B avian pneumoviruses (APV) reveal a novel APV subgroup. J. Gen. Virol., 81: 2723-2733.
Bayraktar, E; Umar, S; Yilmaz, A; Turan, N; Franzo, G; Tucciarone, CM;Cecchinato, M; Cakan, B; Iqbal, M and Yilmaz, M (2018). First molecular characterization of avian metapneumovirus (aMPV) in Turkish broiler flocks. Avian Dis., 62: 425-430.
Cecchinato, M; Catelli, E; Lupini, C; Ricchizzi, E; Clubbe, J; Battilani, M and Naylor, CJ (2010). Avian metapneumovirus (AMPV) attachment protein involvement in probable virus evolution concurrent with mass live vaccine introduction. Vet. Microbiol., 146: 24-34.
Chaboki, PM; Ghalyanchilangeroudi, A; Karimi, V; Abdollahi, H; Maghsoudloo, H; Hosseini, H; Farahani, RK; Ghafouri, SA; Falah, MH; Rezaee, H; Jabbarifakhr, M and Mousavi, FS (2018). Prevalence of avian metapneumovirus subtype B in live bird market in Gilan province, Iran. Vet. Res. Forum., 9: 93-97.
Cook, J (2000). Avian pneumovirus infections of turkeys and chickens. Vet. J., 160: 118-125.
Ghafouri, SA; Fallah, MH; Talakesh, SF; Hosseini, H; Ziafati, Z and Malekan, M (2019). Full genome characterization of Iranian H5N8 highly pathogenic avian influenza virus from Hooded Crow (Corvus cornix), 2017: The first report. Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis., 64: 73-80.
Ghalyanchi-Langeroudi, A; Haghbin-Nazarpak, H and Hosseini, H (2013). Phylogenetic study based on the gene of attachment protein (G) avian metapneumovirus from broiler breeder farm in Iran, 2013. Iran. J. Virol., 7: 7-11.
Govindarajan, D; Buchholz, UJ and Samal, SK (2006). Recovery of avian metapneumovirus subgroup C from cDNA: cross-recognition of avian and human metapneumovirus support proteins. J. Virol., 80: 5790-5797.
Hall, TA (1999). BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series. London, UK, Information Retrieval Ltd., PP: 95-98.
Hartmann, S; Sid, H and Rautenschlein, S (2015). Avian metapneumovirus infection of chicken and turkey tracheal organ cultures: comparison of virus-host interactions. Avian Pathol., 44: 480-489.
Hesami, G and Mayahi, M (2013). Detection of avian metapneumovirus infection in broilers by nested RT-PCR. Vet. Res., 17: 159-166.
Homayounfar, N; Shoushtari, H; Charkhkar, S and Bozorgmehrifard, M (2015). Detection by reverse transcriptase-polymerase chain reaction and molecular characterization of avian metapneumovirus in chicken flocks in Iran. Walia. J., 31: 170-174.
Hosseini, H and Ghalyanchi-Langeroudi, A (2012). Detection and molecular characterization of avian metapneumovirus in Iran: The first report. Iran. J. Virol., 6: 26-31.
Jones, R (1996). Avian pneumovirus infection: questions still unanswered. Avian. Pathol., 25: 639-648.
Jones, R and Rautenschlein, S (2013). Avian meta-pneumovirus. In: Swayne, DE (Ed.), Diseases of poultry. (13th Edn.), Iowa, John Wiley & Sons Inc., PP: 112-120.
Kwon, JS; Lee, HJ; Jeong, SH; Park, JY; Hong, YH; Lee, YJ; Youn, HS; Lee, DW; Do, SH; Park, SY; Choi, IS; Lee, JB and Song, CS (2010). Isolation and characterization of avian metapneumovirus from chickens in Korea. J. Vet. Sci., 11: 59-66.
Malekan, M; VasfiMarandi, M; Ranjbar, MM and Bashashati, M (2016). Molecular evaluation of M2 protein of Iranian avian influenza viruses of H9N2 subtype in order to find mutations of adamantane drug resistance. Iran. J. Vet. Med., 10: 253-262.
Nei, M and Kumar, S (2000). Molecular evolution and phylogenetics. 1st Edn., Oxford, UK, Oxford University Press. PP: 87-111.
Rahimi, M (2011). Seroprevalence of avian metapneumovirus infection in broiler and broiler breeder chickens in Iran. Vet. Med., 56: 395-399.
Saitou, N and Nei, M (1987). The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol. Biol. Evol., 4: 406-425.
Shin, HJ; Cameron, KT; Jacobs, JA; Turpin, EA; Halvorson, DA; Goyal, SM; Nagaraja, KV; Kumar, MC; Lauer, DC; Seal, BS and Njenga, MK (2002). Molecular epidemiology of subgroup C avian pneumoviruses isolated in the United States and comparison with subgroup A and B viruses. J. Clin. Microbiol., 40: 1687-1693.
Tucciarone, CM; Andreopoulou, M; Franzo, G; Prentza, Z; Chaligiannis, I and Cecchinato, M (2017a). First identification and molecular characterization of avian metapneumovirus subtype B from chickens in Greece. Avian Dis., 61: 409-413.
Tucciarone, CM; Franzo, G; Lupini, C; Alejo, CT; Listorti, V; Mescolini, G; Brandao, PE; Martini, M; Catelli, E and Cecch (2017b). Avian Metapneumovirus circulation in Italian broiler farms. Poult. Sci., 97: 503-509.
Umar, S; Sabir, H; Ahmed, A and Subhan, S (2016). Avian metapneumovirus infection in poultry. Worlds Poult. Sci. J., 72: 833-846.
Vasfi-Marandi, M; Malekan, M; Ranjbar, MM; Davachi, ND and Alamian, S (2018). Sequencing and in silico multi-aspect analysis of S1 glycoprotein in 793/B serotype of infectious bronchitis virus isolated from Iran in 2003 and 2011. Arch. Razi Inst., 73: 183-198.
Wei, L; Zhu, S; Yan, X; Wang, J; Zhang, C; Liu, S; She, R; Hu, F; Quan, R and Liu, J (2013). Avian metapneumovirus subgroup C infection in chickens, China. Emerg. Infect. Dis., 19: 1092-1094.