ظهور ویروس واریانت برونشیت عفونی پرندگان در هند

نوع مقاله : مقاله کامل

نویسندگان

چکیده

پیشینه: ویروس برونشیت عفونی (IBV) عامل اتیولوژیک بیماری حاد و بسیار واگیردار برونشیت عفونی (IB) است. برونشیت عفونی ماکیان را در تمام سنین درگیر می‌کند و ضررهای اقتصادی عمده‌ای را به صنعت طیور در سراسر جهان وارد می‌نماید. تغییر مداوم پروتئین خاری (S1) IBV مسؤول شیوع بسیاری از سروتیپ‌ها/ژنوتیپ‌ها در سراسر جهان است. از سال 2003 رده‌های مختلفی از سویه‌های IBV در گله‌های ماکیان هند شناسایی شده‌اند. هدف: شناسایی ژنوتیپ‌های شایع IBV در هند. روش کار: نمونه‌های بافتی از 20 گله IBV مثبت، با نشانه‌های بالینی متفاوت برای تکثیر ژن S1 ویروس برونشیت عفونی به وسیله روش نسخه برداری معکوس واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (RT-PCR) مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج: آمپلیکون‌های مثبت PCR توالی یابی شدند. آنالیز توالی‌ها نشان داد که 14 جدایه از نمونه‌های اخذ شده از مزارع متعلق به رده ژنتیکی (Mass 41 serotype) GI-1 و 2 جدایه متعلق به (UK 4/91 variant IBV strain) GI-13 می‌باشد، یک جدایه‌ در رده ژنتیکی GIII، GV و GVI گروه‌بندی شد و 3 جدایه دیگر متعلق به ژنوتیپ واریانت منحصر به فرد برای هند (GI-24) بودند. همچنین آنالیز فیلوژنیک نوع مشابهی از گروه‌بندی را در جدایه‌ها نمونه‌های اخذ شده از مزارع نشان داد. در بین 14 جدایه GI-1، 12 مورد بین سال‌های 2003 و 2006 و تنها 2 مورد بین سال‌های 2009 و 2011 جدا شده‌اند. دو جدایه متعلق به GI-13 در سال 2007 جدا شدند. یک جدایه متعلق به GIII، GV، و GVI در سال 2010 جدا شد و 3 جدایه به هیچ یک از توالی‌های مرجع IBV که در سال 2006 (IND-TN-168-06)، 2010 (IND-TN-280-10)، و 2011 (IND-TN-290-11) جدا شده‌اند، نزدیک نبودند. نتیجه‌گیری: یک واریانت منحصر به فرد IBV در هند (GI-24) پدیدار شده است. نتایج این مطالعه اثرات مهمی بر اقدامات پیشگیرانه با کمک واکسن‌ها در آینده خواهد داشت.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


Bande, F; Arshad, SS; Omar, AR; Hair-Bejo, M; Mahmuda, A and Nair, V (2017). Global distributions and strain diversity of avian infectious bronchitis virus: a review. Anim. Health Res. Rev., 18: 70-83.
Bayry, J; Goudar, MS; Nighot, PK; Kshirsagar, SG; Ladman, BS and Gelb, J (2005). Emergence of a nephropathogenic avian infectious bronchitis virus with a novel genotype in India. J. Clin. Microbiol., 43: 916-918.
Boursnell, ME; Brown, TD; Foulds, IJ; Green, PF; Tonsley, FM and Binns, MM (1987). Completion of the sequence of the genome of the corona virus avian infectious bronchitis virus. J. Gen. Virol., 68: 57-77.
Casais, R; Dove, B; Cavanagh, D and Britton, P (2003). Recombinant avian infectious bronchitis virus expressing a heterologous spike gene demonstrates that the spike protein is a determinant of cell tropism. J. Virol., 77: 9084-9089.
Cavanagh, D (1983). Coronavirus IBV glycopolypeptides: size of their polypeptide moieties and nature of their oligosaccharide. J. Gen. Virol., 64: 1187-1191.
Cavanagh, D (1997). Nidoviridaes: a new order comprising Coronaviridae and Arteriviridae. Arch. Virol., 142: 629-633.
Cavanagh, D (2001). Commentary. A nomenclature for avian Coronavirus isolates and the question of species status. Avian Pathol., 30: 581-598.
Cavanagh, D (2007). Coronavirus avian infectious bronchitis virus. Vet. Res., 38: 281-297.
Cavanagh, D; Davis, PJ; Cook, JK; Li, D; Kant, A and Koch, G (1992). Location of the amino acid difference in the S1 spike glycoprotein subunit of closely related serotypes of infectious bronchitis virus. Avian Pathol., 21: 33-43.
Cavanagh, D; Elus, MM and Cook, JK (1997). Relationship between variation in the S1 spike protein of infectious bronchitis virus and the extent of cross-protection in vivo. Avian Pathol., 26: 63-74.
Cavanagh, D; Picault, JP; Gough, RE; Hess, M; Mawditt, K and Britton, P (2005). Variation in the spike protein of the 793/B type of infectious bronchitis virus, in the field and during alternate passage in chickens and embryonated eggs. Avian Pathol., 34: 20-25.
Chen, HW; Huang, YP and Wang, CH (2009). Identification of Taiwan and China-like recombinant avian infectious bronchitis viruses in Taiwan. Virus Res., 140: 121-129.
Ducatez, MF; Martin, AM; Owoade, AA; Olatoye, IO; Alkali, BR; Maikano, I; Snoeck, CJ; Sausy, A; Cordioli, P and Muller, CP (2009). Characterization of a new genotype and serotype of infectious bronchitis virus in Western Africa. J. Gen. Virol., 90: 2679-2685.
Elankumaran, S; Balachandran, C; Chandran, NDJ; Roy, P; Albert, A and Manickam, R (1999). Serological evidence for a 793/B related avian infectious bronchitis virus in India. Vet. Rec., 144: 299-300.
Farsang, A; Ros, C; Renstrom, LH; Baule, C; Soos, T and Belak, S (2002). Molecular epizootiology of infectious bronchitis virus in Sweden indicating the involvement of a vaccine strain. Avian Pathol., 31: 229-236.
Gaba, A; Dave, H; Paul, JK and Prajapati, KS (2010). Isolation, identification and molecular characterization of IBV variant from outbreak of visceral gout commercial broilers. Vet. World. 3: 375-377.
Jakhesara, SJ; Nath, B; Pal, JK; Joshi, CG and Kumar, S (2018). Emergence of a genotype I variant of avian infectious bronchitis virus from Northern part of India. Acta Trop., 183: 57-60.
Kant, A; Koch, G; van Roozelaar, DJ; Kusters, JG; Poelwik, FA and van der Zeijst, BA (1992). Location of antigenic sites defined by neutralizing monoclonal antibodies on the S1 avian infectious bronchitis virus glycopolypeptide. J. Gen. Virol., 73: 591-596.
Keeler, CLJr; Reed, KL; Nix, WA and Gelb, JJr (1998). Serotype identification of avian infectious bronchitis virus by RT-PCR of the peplomer (S-1) gene. Avian Dis., 42: 275-284.
Koch, L; Hartog, L; Kant, A and van Roozelaar, DJ (1990). Antigenic domains on the peplomer protein of avian infectious bronchitis virus: correlation with biological functions. J. Gen. Virol., 71: 1929-1935.
Kumanan, K; Tamizh Selvam, N; Dhinakar Raj, G and Nachimuthu, K (2004). Molecular epizootiology of infectious bronchitis isolates in Tamil Nadu indicating the possible involvement of a vaccine strain. Ind. Vet. J., 81: 1307-1310.
Kuo, L; Godeke, GJ; Raamsman, MJ; Masters, PS and Rottier, PJ (2000). Retargeting of coronavirus by substitution of the spike glycoprotein ectodomain: crossing the host cell species barrier. J. Virol., 74: 1393-1406.
Kusters, JG; Niesters, HG; Lenstra, JA; Horzinek, MC and van der Zeijst, BA (1989). Phylogeny of antigenic variants of avian coronavirus IBV. Virology. 169: 217-221.
Lee, CW; Hilt, DA and Jackwood, MW (2003). Typing of field isolates of infectious bronchitis virus based on the sequence of the hypervariable region in the S1 gene. J. Vet. Diagn. Invest., 15: 344-348.
Lim, TH; Lee, HJ; Lee, DJ; Lee, JN; Park, JK; Youn, HN; Kim, MS; Lee, JB; Park, SY; Choi, IS and Song, CS (2011). An emerging recombinant cluster of nephro-pathogenic strains of avian infectious bronchitis virus in Korea. Infect. Genet. Evol., 11: 678-685.
Lin, SY and Chen, HW (2017). Infectious bronchitis virus variants: molecular analysis and pathogenicity investigation. Int. J. Mol. Sci., 18: 2030. doi: 10.3390/ ijms18102030.
Mahmooda, ZH; Sleman, RR and Uthman, AU (2011). Isolation and molecular characterization of Sul/01/09 avian infectious bronchitis virus, indicates the emergence of a
new genotype in the Middle East. Vet. Microbiol., 150: 21-27.
Moore, KM; Jackwood, MW and Hilt, DA (1997). Identification of amino acids involved in a serotype and neutralization specific epitopes within the S1 subunit of avian infectious bronchitis virus. Arch. Virol., 142: 2249-2256.
Parveen, R; Farooq, L; Ahangar, S; Nazki, S; Dar, Z; Dar, T; Kamil, S and Dar, P (2017). Genotyping and phylogenetic analysis of infectious bronchitis virus isolated from broiler chickens in Kashmir. Virus Dis., 28: 434-438.
Patel, BH; Bhimani, MP; Bhanderi, BB and Jhala, MK (2015). Isolation and molecular characterization of nephropathic infectious bronchitis virus isolates of Gujarat state, India. Virus Dis., 26: 42-47.
Sadri, N; Ghalyanchilangeroudi, A; Fallah Mehrabadi, MH; Shayeganmehr, A; Sediqian, MS; Jabbarifakhr, M; Hosseini, H; Hamdan, AM and Mousavi, FS (2018). Genotyping of avian infectious bronchitis virus in Afghanistan (2016-2017): the first report. Iran. J. Vet. Res., 20: 60-63.
Sályi, G (1999). Certain disturbances in nitrogen metabolism of poultry; gout, urolithiasis and baby chick nephropathy. A review of the literature . Magyar Állatorvosok Lapja. 121: 91-99 (in Hungarian with English summary).
Sukumar, S and Prabhakar, TG (1993). An outbreak of infectious bronchitis among poultry in Tamil Nadu. Ind. J. Anim. Sci., 63: 820-822.
Sumi, V; Singh, SD; Dhama, K; Gowthaman, V; Barathidasan, R and Sukumar, K (2012). Isolation and molecular characterization of infectious bronchitis virus from recent outbreaks in broiler flocks reveals emergence of novel strain in India. Trop. Anim. Health Pro., 44: 1791-1795.
Suresh Kumar, K; Dhinakar Raj, G; Raja, A and Ramadass, P (2007). Genotyping of avian infectious bronchitis viruses from India. Ind. J. Biotech., 6: 45-51.
Valastro, V; Holmes, EC; Britton, P; Fusaro, A; Jackwood, MW; Cattoli, G and Monne, I (2016). S1-gene based phylogeny of infectious bronchitis virus: an attempt of harmonize virus classification. Infect. Genet. Evol., 39: 349-364.
Wang, L; Junker, D; Hock, L; Ebiary, E and Collisson, EW (1994). Evolutionary implications of genetic variations in the S1 gene of infectious bronchitis virus. Virus Res., 34: 327-338.
Wang, CH and Tsai, CT (1996). Genetic grouping for the isolates of avian infectious bronchitis viruses in Taiwan. Arch. Virol., 141: 1677-1688.