بررسی فایلوژنی ماهی یال اسبی (Perciformes: Trichiuridae) با استفاده از DNA میتوکندریایی در خلیج فارس

نوع مقاله : مقاله کامل

نویسندگان

چکیده

در این مطالعه، با استفاده از آنالیز DNA میتوکندریایی 16S ribosomal DNA (rDNA)، ارتباط فایلوژنی ماهی یال اسبی متعلق به منطقه خلیج فارس در مقایسه با دیگر نقاط دنیا مورد بررسی قرار گرفت. محصول واکنش زنجیره‌ای پلیمراز با وزن مولکولی 600 جفت باز از توالی‌ یابی ژن 16S rDNA حاصل گردید. نتایج به دست آمده نشان داد که توالی به دست آمده دارای 42 نقطه جابجایی نسبت به دیگر نمونه‌های گزارش شده از سراسر جهان می‌باشد. ارتباط فایلوژنی بین این مجموعه نشان از وجود 18 هاپلوتایپ در 5 شاخه متفاوت با درصد قابل قبول از Bootstrap Test بود. رسم درخت فایلوژنی با استفاده از دو معیار Neighbor-Joining و Parsimony نشان از وجود دو شاخه مجزا شامل یک سری از هاپلوتایپ‌های منطقه هند-اقیانوس آرام (Indo-Pacific) با دو گروه خواهری که نمونه متعلق به ایران را نیز در بر می‌گیرد و دیگر شاخه به طور شفاف نمونه‌های منطقه اقیانوس اطلس غربی و ژاپن را از دیگر نمونه‌ها جدا کرده که نشان از اختلاف ژنتیکی مشخص بین این دو منطقه می‌باشد. ساختار ژنتیکی به دست آمده از نمونه متعلق به منطقه خلیج فارس در مقایسه با نمونه‌های مناطق مجاور نشان از یک نوع تشابه ژنتیکی بین این مناطق دارد که انجام مدیریت یکسان در جهت حفظ و برداشت از این ذخایر را بیان می‌دارد.

کلیدواژه‌ها


Allard, MW; Miyamoto, MM; Jareche, L; Kraus, F and Tennant, MR (1992). DNA systematics and evolution of the artiodactyls family Bovidae. Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 89: 3972-3976.
Baik, CI and Park, JH (1986). Relationship between oceanographic condition and catch of the hairtail, Trichiurus lepturus Linn C from the Stow Net. Bull. Fish Res. Dev. Agency. 39: 29-41.
Bourdy, P; Heurtebise, S and Lapegue, S (2003). Mitochondrial and nuclear DNA sequence variation of presumed Crassostrea gigas and Crassostrea angulata specimens: a new oyster species in Hong Kong. Aquaculture. 228: 15-25.
Brown, WM; Prager, EM; Wang, A and Wilson, AC (1982). Mitochondrial DNA sequences of primates: tempo and mode of evolution. J. Mol. Evol., 18: 225-239.
Dekun, Z and Cungen, Y (1987). The relation of the environment of fishing ground with the occurrence of hairtail in winter off the middle part of Zhejiang. 1. Fish. China. 11: 195-204.
Duke, NC (1992). Mangrove floristics and biogeography. PP: 63-100. In: Robertson, AI and Alongi, DM (Eds.), Tropical mangrove ecosystems, coastal and estuarine studies series. American Geophysical Union, Washington, D.C., P: 329.
FAO (2009). Fishery statistics yearbook. Catches and landings. Vol. 91, FAO, Rome. P: 206.
Hall, BG (2004). Phylogenetics trees made easy: a how-to manual for molecular biologists, Sunderland, Massa-chusetts, Sinauer Associates. P: 443.
Kimura, M (1980). A simple method for estimating evolu-tionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. J. Mol. Evol., 16: 111-120.
Kimura, S and Matsuura, K (2003). Fishes of Bitung, northern tip of Sulawesi, Indonesia. Tokyo, Ocean Research Institute, University of Tokyo. P: vi+244.
Lam, K and Morton, B (2003). Mitochondrial DNA and morphological identification of a new species of Crassostrea (Bivalvia: Ostreidae) cultured for centuries in the Pearl River Delta, Hong Kong, China. Aquaculture. 228: 1-13.
Martins, AS and Haimovici, M (1996). Distribution, abundance and biological interactions of the cutlassfish Trichiurus lepturus in the southern Brazil subtropical convergence ecosystem. Fish. Res., 30: 217-227.
Meriem, SB; Al-Marzouqi, A; Al-Mamry, J and Al-Mazroui, A (2011). Stock assessment and potential management of Trichiurus lepturus fisheries in the Arabian Sea, Oman. J. Fish Aquat. Sci., 6: 212-224.
Milinkovitch, MC; Orti, G and Meyer, A (1993). Revised phylogeny of whates suggested by mitochondrial ribosomal DNA sequences. Nature. 361: 346-348.
Miya, M and Nishida, M (1996). Molecular phylogenetic perspective on the evolution of the deep-sea fish genus Cyclothone (Stomiiformes: Gonostomatidae). Ichthyol. Res., 43: 375-398.
Nakabo, T (2002). Family Trichiuridae. In: Nakabo, T (Ed.), Fishes of Japan with pictorial keys to the species. Tokyo, TokaiUniversity Press. PP: 1344-1345.
Nakamura, I and Parin, NV (1993). FAO species catalogue. Vol. 15. Snake mackerels and cutlassfishes of the world (Families Gempylidae and Trichiuridae). An annotated andillustrated catalogue of the snake mackerels, shocks, escolars, gemfishes, sack fishes, domine, oilfish, cutlassfishes, scabbardfishes, hair-tails, and frostfishes known todate. Fisheries Synopsis No. 125, Vol. 15, FAO, Rome, P: 136.
Raeisi, H; Hosseini, SA; Paighambari, SY; Taghavi, SAA and Davoodi, R (2011). Species composition and depth variation of cutlassfish (Trichiurus lepturus L. 1785) trawl by catch in the fishing grounds of Bushehr waters. Persian Gulf. 10: 17610-17619.
Randall, JE (1995). Coastal fishes of Oman. Bathurst, New South Wales, Australia, Crawford House Publishing Pty Ltd., P: 439.
Reynolds, RM (1993). Physical oceanography of the Gulf, Strait of Hormuz, and the Gulf of Oman: results from the Mitchell Expedition. Marine Poll. Bull., 27: 35-60.
Sambrook, J; Fritsch, EF and Maniatis, T (1989). Molecular cloning: a laboratory manual. 2nd Edn., Cold Spring Harbor, NY, ColdSpringHarbor Laboratory Press. P: 1622.
Tamura, K; Dudley, J; Nei, M and Kumar, S (2007). MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA software). Version 4.0. Mol. Biol. Evol., 24: 1596-1599.
Tokimura, M; Yamada, U and Irie, T (1995). Comments on taxonomy and distributions of the species of Trichiurus in the East China and YellowSeas and adjacent waters. Seikaku Suisan Kenkyusho News. 80: 12-14.
UNEP (United Nations Environment Programme) (1999). Overview on land-based sources and activities affecting the marine environment in the ROPME Sea area. UNEP/GPA Coordination Office & ROPME. P: 127.
Yamada, U; Shirai, S; Irie, T; Tokimura, M; Deng, S; Zheng, Y; Li, CS; Kim, YU and Kim, YS (1995). Names and illustrations of fishes from the East China Sea and the Yellow Sea. Tokyo, Overseas Fishery Cooperation Foundation. P: xi+288.