Shiraz University Iranian Journal of Veterinary Research 1728-1997 12 4 2011 12 01 Phylogenetic analysis of PB2 gene of H9N2 subtype of avian influenza viruses isolated from commercial chickens in Tehran province of Iran during 1998-2001 مطالعه شجره‌شناسی ژن PB2 ویروس‌های H9N2 آنفلوانزای پرندگان جدا شده از طیور صنعتی استان تهران طی سال‌های 1998 تا 2001 324 331 84 10.22099/ijvr.2011.84 EN J Pazani Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran V. Karimi Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran M. H. Bozorgmehri Fard Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran A. Ghalyanchi Langeroudi Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran A. Barin Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran Journal Article 2010 10 12 <p>The PB2 protein of influenza A viruses has been shown as host range determinant. In this study PB2<br />gene of five H9N2 isolates from Tehran province during the period of 1998-2001 were partially amplified<br />and sequenced to do phylogenetic study. Iranian isolates could be classified in Eurasian lineage according to<br />their PB2 gene sequences. The PB2 genes of these isolates are different from those of Middle-East countries<br />such as the UAE, Pakistan and Saudi Arabia, as well as India, and it is probable that their ancestors have<br />undergone reassortment with other subtypes. The Nucleotide sequences of their PB2 are highly similar to<br />each other with 97.5-99.6% homology percentage showing the least mutations in their genes during the<br />period of 1998 to 2001. The PB2 of the Iranian isolates contain Glutamic acid-(E) in position 627, Aspartic<br />acid-(D) in 701 and Serine-(S) in 714 as other avian isolates.</p> <p dir="RTL">پروتئین PB2 ویروس‌های آنفلوانزای A نقش مهمی در تعیین طیف میزبانی آن‌ها دارد. در این مطالعه بخشی از ژن PB2 ویروس‌های آنفلوانزای H9N2 جدا شده از جوجه مرغ‌های تجاری در استان تهران تکثیر و توالی نوکلئوتیدی و اسید آمینه‌ای آن‌ها تعیین گردیدند. تجزیه و تحلیل و مطالعه شجره‌شناسی این توالی‌ها و مقایسه آن‌ها با برخی توالی‌های موجود در بانک جهانی ژن از ویروس‌های H9N2 انجام گردید. مطالعه شجره‌شناسی به روی توالی‌های ژن PB2 استفاده شده در این مطالعه نشان می‌دهد که جدایه‌های H9N2 ایران را می‌توان در دودمان اروپایی-آسیایی طبقه‌بندی نمود؛ همان طوری که بر اساس نتایج حاصل از مطالعه‌های انجام شده به روی ژن HA نیز مشخص شده است. در پروتئین PB2 جدایه‌های H9N2 ایران در این مطالعه در محل 621 گلوتامیک اسید، در 701 آسپارتیک اسید و در 714 سرین قرار دارد. وضعیت مشابهی در مورد تحت تیپ‌های مختلف جدا شده از گونه‌های پرندگان در سطح دنیا نشان داده شده است. منشاء ژن PB2 جدایه‌های ایرانی متفاوت از امارات متحده عربی، پاکستان، عربستان سعودی (کشورهای خاورمیانه) و هند می‌باشد و احتمال دارد که اجداد ایزوله‌های H9N2 ایرانی دچار بازآرایی با سایر تحت تیپ‌ها شده باشند. توالی نوکلئوتیدی ژن PB2 این پنج جدایه ایرانی تشابه بالایی در حدود 5/97% تا 6/99% با یکدیگر دارند که نشان می‌دهد طی سال‌های 1998 تا 2001 جهش‌های بسیار کمی در آن‌ها رخ داده است. مطالعه ژن PB2 در جدایه‌های سال‌های اخیر از سایر استان‌ها جهت بررسی تغییرات ممکن در آن و نیز مطالعه بیماری‌زایی جدایه‌های ایرانی در میزبان پستاندار قابل توصیه می‌باشد.</p> https://ijvr.shirazu.ac.ir/article_84_f7ff368b667f71f8e80a6eaefb2e5465.pdf