Shiraz University Iranian Journal of Veterinary Research 1728-1997 25 3 2024 09 20 The first comprehensive study on isolation and genetic characterization of canine parvoviruses from dogs in Mizoram, India reveals the emergence of CPV-2c اولین مطالعه جامع جداسازی و شناسایی ژنتیکی پاروویروس‌های سگ‌سانان از سگ‌ها در میزورام، هند ظهور CPV-2c را نشان می‌دهد 261 272 7875 10.22099/ijvr.2024.49573.7295 EN P. Chakraborty Ph.D. Student in Veterinary Medicine, Department of Veterinary Medicine, West Bengal University of Animal and Fishery Sciences, West Bengal, Kolkata-700037, India S. K. Behera Department of Veterinary Medicine, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India M. H. Lalhriatchhungi Graduated from Regional Institute of Paramedical and Nursing Sciences, Zemabawk-796 017, Aizawl, Mizoram, India P. Roychoudhury Department of Veterinary Microbiology, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India L. Maibam MVSc in Veterinary Medicine, Department of Veterinary Medicine, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India P. Behera Department of Physiology and Biochemistry, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India J. K. Chaudhary Department of Animal Breeding and Genetics, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India H. Prasad Department of Veterinary Medicine, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India J. B. Rajesh Department of Veterinary Medicine, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India M. Lalhmangaihzuali MVSc in Veterinary Medicine, Department of Veterinary Medicine, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India H. C. J. Mary MVSc in Veterinary Medicine, Department of Veterinary Medicine, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India L. H. Lalrosanga MVSc in Veterinary Surgery and Radiology, Department of Veterinary Surgery and Radiology, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India M. S. Dawngliana MVSc in Animal Reproduction and Gynaecology, College of Veterinary Sciences and Animal Husbandry, Central Agricultural University, Selesih-796 015, Aizawl, Mizoram, India V. Chander Division of Immunology (CADRAD), ICAR-Indian Veterinary Research Institute, Izatnagar, Bareilly, Uttar Pradesh, India M. Kumar Department of Veterinary Medicine, Bihar Veterinary College, Bihar Animal Sciences University, Patna-800014, India Journal Article 2024 02 24 Background: Canine parvovirus type-2 (CPV-2) is a highly contagious enteric pathogen of puppies with worldwide distribution. Aims: Molecular epidemiology, genetic characterization, phylogenetic analysis, and isolation of the CPV-2 virus from clinically affected dogs in Mizoram, India over eight years. Methods: A total of 202 samples (199 fecal samples, 2 vomita, and 1 tissue sample) were screened by PCR assay. Results: 103 out of 202 samples (50.99%) tested positive. Of the 103 positive samples, 83 samples were cloned and sequenced. Sequence analysis showed CPV-2c as the predominant variant (63.85%) followed by the 2a variant (26.5%), 2b (8.43%), and FPV (1.2%). Phylogenetic analyses of the CPV-2c sequences formed separate clusters and were ancestrally related to Japanese, Chinese, and Italian 2c sequences. Similarly, 2a isolates formed separate clusters under different clades and were ancestrally related to Indian, Singaporean, Japanese, Uruguayan, and Chinese 2a isolates. 2b isolates formed a single cluster with the Chinese 2b isolate. FPV isolate clustered with North American FPV. Both synonymous and non-synonymous mutations (unique to this study) were evident in all the types of CPV-2s indicative of active evolution with regional variation. In the cell culture medium, CPV-2 showed cytopathogenic effects at the third passage level. Conclusion: The study, the first in-depth report on CPV-2, showed a shift towards CPV-2c as the predominant variant in Mizoram. This variant clustered separately from current vaccine strains, highlighting the need for extensive epidemiological surveillance to better understand viral phylogenomics and evaluate current vaccine efficacy. پیشینه: پاروویروس سگ سانان نوع 2 (CPV-2) یک پاتوژن روده‌ای بسیار مسری توله سگ‌ها با توزیع جهانی است. هدف: اپیدمیولوژی مولکولی، خصوصیات ژنتیکی، تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک، و جداسازی ویروس CPV-2 از سگ‌های مبتلا به فرم بالینی در میزورام، هند در طول هشت سال. روش کار: در مجموع 202 نمونه (199 نمونه مدفوع، 2 نمونه استفراغ و 1 نمونه بافت) با استفاده از روش PCR غربالگری شدند. نتایج: 103 نمونه (99/50%) از 202 نمونه مثبت شدند. از 103 نمونه مثبت، 83 نمونه کلون و توالی یابی شدند. تجزیه و تحلیل توالی، CPV-2c را به عنوان واریانت غالب (86/63%) نشان داد و به دنبال آن واریانت 2a (5/26%)، 2b (43/8%) و FPV (2/1%) بودند. آنالیزهای فیلوژنتیکی توالی‌های CPV-2c خوشه‌های جداگانه‌ای را تشکیل دادند و اجدادی به دنباله‌های C2 ژاپنی، چینی و ایتالیایی مربوط بودند. به طور مشابه، جدایه‌های A2 خوشه‌های جداگانه‌ای را در زیر کلادهای مختلف تشکیل دادند و اجدادی به جدایه‌های هندی، سنگاپوری، ژاپنی، اروگوئه‌ای و چینی A2 داشتند. جدایه‌های B2 با جدایه چینی B2 یک خوشه واحد تشکیل دادند. جدایه‌های FPV با FPV آمریکای شمالی خوشه‌بندی شدند. هر دو جهش مترادف و غیر مترادف (که در این مطالعه منحصر به فرد است) در همه انواع CPV-2 مشهود بود که نشان دهنده تکامل فعال با تنوع منطقه‌ای است. در محیط کشت سلولی، CPV-2 اثرات سیتوپاتوژنیک را در سطح پاساژ سوم نشان داد. نتیجه‌گیری: مطالعه، اولین گزارش دقیق در مورد CPV-2، تغییر به سمت CPV-2c را به عنوان واریانت غالب در میزورام نشان داد. این جدایه متفاوت از سویه‌های رایج واکسن شونده کنونی دسته‌بندی شد و نیاز به نظارت اپیدمیولوژیک گسترده برای درک بهتر فیلوژنومیک ویروسی و ارزیابی کارایی واکسن فعلی را برجسته کرد.

https://ijvr.shirazu.ac.ir/article_7875_834926a179cfa69194724b7c8ad54bb1.pdf