Shiraz University Iranian Journal of Veterinary Research 1728-1997 21 3 2020 09 01 The emergence of Q1 genotype of avian infectious bronchitis virus in Iran, 2019: the first report ظهور ژنوتیپ Q1 ویروس برونشیت عفونی پرندگان در ایران، 1398: اولین گزارش 230 233 5651 10.22099/ijvr.2020.35858.5252 EN A. Ghalyanchilangeroudi Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran H. Najafi Department of Pathobiology, School of Veterinary Medicine, Shiraz University, Shiraz, Iran, and Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran (current address) M. H. Fallah Mehrabadi Department of Poultry Diseases, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran Z. Ziafati Kafi Ph.D. Student in Virology, Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran N. Sadri Ph.D. Student in Virology, Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran A. Hojabr Rajeoni Ph.D. Student in Virology, Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran A. Modiri Graduated from Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran A. Safari Graduated from Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran H. Hosseini 6Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, Karaj Branch, Islamic Azad University, Karaj, Iran Journal Article 2019 12 25 <strong>Background:</strong> Avian infectious bronchitis (IB) is an infectious viral disease of chickens. The effective protection of chickens against many different infectious bronchitis virus (IBV) variants is not achieved unless the circulating genotypes in the region are identified and the cross-protection of the potential of vaccines in use is assessed. <strong>Aims:</strong>In a monitoring program of IBVs, a new genotype was identified in the north of Iran, 2019. This work was conducted to isolate and characterize this new IBV genotype. <strong>Methods:</strong> Tracheal tissues were collected from chickens showing signs of respiratory involvement. Specimens were homogenized and inoculated to the allantoic fluid of embryonated specific pathogen-free (SPF) eggs. Infectious bronchitis virus was detected using real time-polymerase chain reaction (RT-PCR). The hypervariable region of the IBV <em>S1</em> gene was amplified for sequencing. <strong>Results:</strong> Positive samples were phylogenetically analyzed, and both positive isolates were clustered with Q1 IBV strains. <strong>Conclusion:</strong> This is the first report of the Q1 outbreak in Iran. More investigations are needed to find the role of Q1 IBV in the respiratory disease complex of chickens. <strong>پیشینه:</strong>برونشیت عفونی پرندگان (IB) یک بیماری ویروسی عفونی ماکیان است. محافظت موثر ماکیان علیه تعدادی از واریانت‌های مختلف ویروس برونشیت عفونی (IBV) به دست نمی‌آید مگر اینکه ژنوتیپ‌های در حال چرخش در آن ناحیه شناسایی شوند و توانایی محافظت متقاطع واکسن‌های در حال استفاده به دست آید. <strong>هدف:</strong> در یک برنامه نظارتی IBVs، یک ژنوتیپ جدید در شمال ایران در سال 1398 شناسایی شد. این مطالعه به منظور جدا سازی و مشخص کردن این ژنوتیپ جدید IBV انجام شد. <strong>روش کار:</strong> بافت‌های نای از ماکیان‌ که علایم تنفسی داشتند جمع آوری شد. نمونه‌ها همگن و به مایع آلانتوئیک تخم مرغ‌های جنین‌دار عاری از عوامل بیماری‌زا (SPF) تلقیح شدند. ویروس برونشیت عفونی به وسیله واکنش زنجیره‌ای پلیمراز زمان حقیقی (RT-PCR) شناسایی شد. ناحیه بسیار متغیر ژن <em>S1</em> ویروس برونشیت عفونی برای توالی یابی تکثیر شد. <strong>نتایج:</strong> نمونه‌های مثبت از لحاظ فیلوژنی تحلیل شدند، و دو جدایه‌ مثبت همراه با سویه‌های Q1 ویروس برونشیت عفونی در یک خوشه قرار گرفتند. <strong>نتیجه‌گیری:</strong> این اولین گزارش شیوع Q1 در ایران است. تحقیقات بیشتری به منظور یافتن نقش ژنوتیپ Q1 ویروس برونشیت عفونی در کمپلکس بیماری تنفسی ماکیان مورد نیاز است. https://ijvr.shirazu.ac.ir/article_5651_4a38b5c955abed7744cd332002eedce0.pdf