Shiraz University Iranian Journal of Veterinary Research 1728-1997 21 1 2020 03 01 Emergence of variant avian infectious bronchitis virus in India ظهور ویروس واریانت برونشیت عفونی پرندگان در هند 33 39 5438 10.22099/ijvr.2019.32861.4900 EN A. Raja Department of Animal Biotechnology, Madras Veterinary College, Tamil Nadu Veterinary and Animal Sciences University, Chennai, Tamil Nadu, India G. Dhinakar Raj Center for Animal Health Studies, Tamil Nadu Veterinary and Animal Sciences University, Chennai, Tamil Nadu, India K. Kumanan Bioinformatics Centre and ARIS Cell, Madras Veterinary College, Tamil Nadu Veterinary and Animal Sciences University, Chennai, Tamil Nadu, India Journal Article 2019 03 09 Background: Infectious bronchitis virus (IBV) is the etiological agent of an acute and highly contagious disease. Infectious bronchitis (IB) affects chicken of all ages and poses major economic loses to the poultry industry worldwide. The continuous evolution of the spike protein (S1) of IBV is responsible for the prevalence of many serotypes/genotypes around the world. Multiple lineages of IBV strains have been detected in chicken flocks in India since 2003. Aims: To detect IBV genotypes prevalent in India. Methods: Organ samples from 20 IBV-positive flocks with variable clinical signs were used for the amplification of the S1 gene of IBV by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR). Results: Positive PCR amplicons were sequenced. Sequence analysis showed that 14 field isolates belonged to the GI-1 genetic lineage (Mass 41 serotype), two field isolates belonged to the GI-13 (UK 4/91 variant IBV strain), one field isolate grouped with GIII, GV, and GVI genetic lineage and three belonged to a variant genotype unique to India (GI-24). Phylogenetic analysis also showed a similar type of grouping within the field isolates. Among the fourteen GI-1 isolates, 12 were isolated between 2003 and 2006 and only two were isolated between 2009 and 2011. The two field isolates belonging to GI-13 were isolated in 2007, another one belonging to GIII, GV, and GVI was isolated in 2010 and three field isolates were not close to any reference IBV sequences isolated in 2006 (IND-TN-168-06), 2010 (IND-TN-280-10) and 2011 (IND-TN-290-11). Conclusion: A unique variant of IBV is emerging in India (GI-24). Our findings will have important implications for future vaccine intervention. پیشینه: ویروس برونشیت عفونی (IBV) عامل اتیولوژیک بیماری حاد و بسیار واگیردار برونشیت عفونی (IB) است. برونشیت عفونی ماکیان را در تمام سنین درگیر می‌کند و ضررهای اقتصادی عمده‌ای را به صنعت طیور در سراسر جهان وارد می‌نماید. تغییر مداوم پروتئین خاری (S1) IBV مسؤول شیوع بسیاری از سروتیپ‌ها/ژنوتیپ‌ها در سراسر جهان است. از سال 2003 رده‌های مختلفی از سویه‌های IBV در گله‌های ماکیان هند شناسایی شده‌اند. هدف: شناسایی ژنوتیپ‌های شایع IBV در هند. روش کار: نمونه‌های بافتی از 20 گله IBV مثبت، با نشانه‌های بالینی متفاوت برای تکثیر ژن S1 ویروس برونشیت عفونی به وسیله روش نسخه برداری معکوس واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (RT-PCR) مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج: آمپلیکون‌های مثبت PCR توالی یابی شدند. آنالیز توالی‌ها نشان داد که 14 جدایه از نمونه‌های اخذ شده از مزارع متعلق به رده ژنتیکی (Mass 41 serotype) GI-1 و 2 جدایه متعلق به (UK 4/91 variant IBV strain) GI-13 می‌باشد، یک جدایه‌ در رده ژنتیکی GIII، GV و GVI گروه‌بندی شد و 3 جدایه دیگر متعلق به ژنوتیپ واریانت منحصر به فرد برای هند (GI-24) بودند. همچنین آنالیز فیلوژنیک نوع مشابهی از گروه‌بندی را در جدایه‌ها نمونه‌های اخذ شده از مزارع نشان داد. در بین 14 جدایه GI-1، 12 مورد بین سال‌های 2003 و 2006 و تنها 2 مورد بین سال‌های 2009 و 2011 جدا شده‌اند. دو جدایه متعلق به GI-13 در سال 2007 جدا شدند. یک جدایه متعلق به GIII، GV، و GVI در سال 2010 جدا شد و 3 جدایه به هیچ یک از توالی‌های مرجع IBV که در سال 2006 (IND-TN-168-06)، 2010 (IND-TN-280-10)، و 2011 (IND-TN-290-11) جدا شده‌اند، نزدیک نبودند. نتیجه‌گیری: یک واریانت منحصر به فرد IBV در هند (GI-24) پدیدار شده است. نتایج این مطالعه اثرات مهمی بر اقدامات پیشگیرانه با کمک واکسن‌ها در آینده خواهد داشت.

https://ijvr.shirazu.ac.ir/article_5438_13e6d89f435122d79f0851db464d5943.pdf