Shiraz University Iranian Journal of Veterinary Research 1728-1997 16 4 2015 11 01 Novel polymorphism of AA-NAT gene in Indian goat breeds differing in reproductive traits پلی‌مورفیسم جدید ژن AA-NAT در نژادهای بز هندی مختلف از لحاظ صفات تولید مثلی 377 380 3292 10.22099/ijvr.2015.3292 EN R. Sharma Core Lab, National Bureau of Animal Genetic Resources, Karnal-132001, India S. Ahlawat Core Lab, National Bureau of Animal Genetic Resources, Karnal-132001, India M. S. Tantia Core Lab, National Bureau of Animal Genetic Resources, Karnal-132001, India Journal Article 2015 04 20 This is the first description of the polymorphisms of arylalkylamine-N-acetyltransferase (AA-NAT) gene in Indian goats with different reproductive traits (twinning percentage and age of sexual maturity). Based on the important role of AA-NAT in reproduction, it is considered as a possible candidate gene for this trait. Two novel synonymous SNPs, C825T (exon2) and C1249T (exon3) were identified. All three possible genotypes (CC, CT and TT) were identified for C825T mutation whereas two genotypes were observed (CC and CT) for C1249T mutation. SNPs C825T and C1249T changed recognition site of restriction enzyme BtsCI (GGATG) and AciI (CCGC) and thus can be genotyped by the relatively simple and cost effective technique of PCR-RFLP for establishing further association with reproductive traits. Present results add to the meager existing knowledge and extend the spectrum of genetic variation of caprine candidate genes of reproductive traits, which is another step towards improvement of goat genetic resources and breeding.  این اولین توصیف پلی‌مورفیسم‌های ژن آریل آلکیل آمین-N-استیل ترانسفراز (<em>AA-NAT</em>) در بزهای هندی با صفات تولید مثلی متفاوت (درصد دوقلوزایی و سن بلوغ جنسی) می‌باشد. بر اساس نقش مهم <em>AA-NAT</em> در تولید مثل، آن به عنوان یک ژن کاندید احتمالی برای این صفت در نظر گرفته می‌شود. دو SNPs مشابه جدید C825T (exon2) و C1249 (exon3) شناسایی شدند. هر سه ژنوتیپ احتمالی CC)، CT و (TT برای جهش C825T شناسایی شدند، در حالی که برای جهش C1249T دو ژنوتیپ CC) و (CT مشاهده شدند. SNPs C825T و C1249T محل شناسایی آنزیم محدود کننده <em>BtsCI</em> (GGA<em>T</em>G) و <em>AciI</em> (C<em>C</em>GC) را تغییر دادند و از اینرو می‌توانند با استفاده از روش نسبتا ساده و مقرون به صرفه PCR-RFLP برای ایجاد ارتباط بیشتر با صفات تولید مثلی تعیین ژنوتیپ شوند. نتایج حاضر به دانش اندک موجود افزوده و گستره تنوع ژنتیکی ژن‌های بزی کاندید صفات تولید مثلی را توسعه می‌بخشد که این گام دیگری در جهت بهبود منابع ژنتیکی بزها و تولید مثل می‌باشد. https://ijvr.shirazu.ac.ir/article_3292_fd1d3002ed735eec3746329d3514cbc0.pdf