@article { author = {Baba Sheikh, M. O. and Rashid, P. M. A. and Marouf, A. S. and Raheem, Z. H. and Janga, S. C.}, title = {Phylogenic analysis of serotype Asia1 foot-and-mouth disease virus from Sulaimani/Iraq using VP1 protein: heterogeneity with vaccine strain As1/Shamir/89}, journal = {Iranian Journal of Veterinary Research}, volume = {18}, number = {3}, pages = {212-215}, year = {2017}, publisher = {Shiraz University}, issn = {1728-1997}, eissn = {2252-0589}, doi = {10.22099/ijvr.2017.4226}, abstract = {Foot-and-mouth disease virus (FMDV) serotypes O, A and Asia1 are responsible for a significant number of disease outbreaks in Iraq. The current study can be considered as the first molecular characterization of serotype Asia1 in Iraq. The present investigation reports the detection of serotype FMDV Asia1 from local farms in Sulaimani districts in 2012 and 2014 outbreaks. Phylogenetic analysis of the complete VP1 gene has shown that FMDV Asia1 field isolates were under genetic novel variant Sindh-08 (group VII) including PAK/iso/11 and TUR/13 strains. The VP1 protein sequence of circulatory FMDV Asia1 genotype showed heterogeneity of nine amino acid substitutions within the G-H loop with the vaccine strain As1/Shamir/89 (JF739177) that is currently used in vaccination program in Iraq. Our result indicated that differences in VP1 protein at G-H loop of the locally circulated FMDV serotype Asia1 strain may be a reason for current vaccination failure.}, keywords = {Molecular genotyping,Phylogenetic analysis,viral evolution}, title_fa = {آنالیز فیلوژنیک سروتیپ Asia1 سلیمانیه/عراق ویروس بیماری پا و دهان با استفاده از پروتئین VP1: هتروژنوئیتی با سویه واکسن As1/Shamir/89}, abstract_fa = {سروتیپ‌های O، A و Asia1 ویروس بیماری پا و دهان یا تب برفکی (FMDV) مسؤول تعداد قابل توجهی از رخداد بیماری در عراق هستند. مطالعه حاضر می‌تواند به عنوان اولین تعیین خصوصیات مولکولی سروتیپ Asia1 در عراق محسوب شود. بررسی حاضر ردیابی سروتیپ Asia1 FMDV از مزارع محلی در صحراهای سلیمانیه در رخدادهای 2012 و 2014 را گزارش می‌کند. آنالیز فیلوژنیک ژن کامل VP1 نشان داده است که جدایه‌های مزرعه‌ای FMDV Asia1، بخشی از واریانت جدید ژنتیکی Sindh-08 (group VII) شامل سویه‌های PAK/iso/11 و TUR/13 بودند. توالی پروتئین VP1 از ژنوتیپ FMDV Asia1 گردش خون هتروژنوسیتی 9 جایگزین اسید آمینه در حلقه G-H با سویه واکسنی As1/Shamir/89 (JF39177) را نشان داد که در حال حاضر در برنامه واکسیناسیون در عراق استفاده می‌شود. نتایج ما نشان داد که تفاوت‌ها در پروتئین VP1 در حلقه G-H سویه سروتیپ Asia1 FMDV در جریان موضعی ممکن است دلیلی برای شکست واکسیناسیون فعلی باشد.}, keywords_fa = {تعیین ژنوتیپ مولکولی,آنالیز فیلوژنتیک,تکامل ویروسی}, url = {https://ijvr.shirazu.ac.ir/article_4226.html}, eprint = {https://ijvr.shirazu.ac.ir/article_4226_97fef59715c10306e11d2e1184e11cc8.pdf} }