@article { author = {Mahanti, A. and Samanta, I. and Bandyopadhyay, S. and Joardar, S. N.}, title = {Molecular characterization and antibiotic susceptibility pattern of caprine Shiga toxin producing-Escherichia coli (STEC) isolates from India}, journal = {Iranian Journal of Veterinary Research}, volume = {16}, number = {1}, pages = {31-35}, year = {2015}, publisher = {Shiraz University}, issn = {1728-1997}, eissn = {2252-0589}, doi = {10.22099/ijvr.2015.2920}, abstract = {The present study was conducted to detect the occurrence, serotype, genotype, phylogenetic relationship and antimicrobial resistance pattern of STEC from healthy goats of West Bengal, India. From the 125 faecal samples collected from healthy goats, 245 isolates were identified as Escherichia coli. The E. coli harbouring any gene for Shiga toxins (stx1/stx2) was detected in 36 (14.7%) of the 245 E. coli isolates. These STEC strains belonged to 22 different serogroups (O2, O5, O20, O21, O22, O25, O41, O44, O45, O60, O71, O76, O84, O85, O87, O91, O103, O112, O113, O120, O156, and O158) and three were untypeable. The stx1 and stx2 was detected in 26 (72.2%) and 21 (58.3%) of Shiga toxin producing-E. coli (STEC) isolates, respectively. Further, E. coli harbouring eaeA only (Enteropathogenic E. coli) and ehxA was detected in 22 (61.1%) and 28 (77.7%) isolates, respectively. Whereas the saa was present in 8 (22.2%) E. coli isolates. The subtyping of the 26 E. coli strains possessing stx1 showed that 73.% (19/26) of these isolates were positive for stx1C subtype. Of the 21 isolates with the stx2 gene, 42.8% (9/21) were positive for stx2C, and 38.1% (8/21) were positive for stx2d gene. The phylogenetic analysis of STEC strains after RAPD reveals eight major clusters. However, no serogroup specific cluster was observed. Resistance was observed most frequently to erythromycin (80.5%), amikacin (52.7%), cephalothin (50%), kanamycin (41.6%), neomycin (36.1%) and gentamycin (36.1%) and less frequently to norfloxacin (2.7%), enrofloxacin (2.7%), and ciprofloxacin (2.7%). Multidrug resistance was observed in eleven STEC isolates.}, keywords = {Goat,EPEC,STEC,West Bengal}, title_fa = {خصوصیات مولکولی و الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی جدایه‌های اشریشیا کولای تولید کننده شیگا توکسین (STEC) بزی از هند}, abstract_fa = {مطالعه حاضر به منظور شناسایی رخداد، سروتیپ، ژنوتیپ، رابطه فیلوژنیک و الگوی مقاومت ضد میکروبی STEC از بزهای سالم بنگال غربی، هند انجام گرفت. از 125 نمونه مدفوع جمع‌آوری شده از بزهای سالم، 245 جدایه به عنوان اشریشیا کولای شناسایی شدند. اشریشیا کولای‌های دارنده هر ژن توکسین‌های شیگا (stx1/stx2) در 36 مورد از 245 جدایه اشریشیا کولای شناسایی شدند. این سویه‌های STEC متعلق به 22 گروه سرمی مختلف O2)، O5، O20، O21، O22، O25، O41، O44،‌ O45، O60، O71،‌ O76،‌ O84،‌ O85، O87، O91، O103،‌ O112، O113، O120، O156 و (O158 بودند و سه مورد غیر قابل گروه‌بندی بودند. stx1 و stx2 به ترتیب در 26 (2/72%) و 21 (3/58%) جدایه اشریشیا کولای تولید کننده شیگا توکسین شناسایی شدند. سپس، اشریشیا کولای دارای eaeA تنها (اشریشیا کولای انتروپاتوژنیک) و ehxA به ترتیب در 22 (1/61%) و 28 (7/77%) جدایه تشخیص داده شدند. در حالی که، saa در 8 (2/22%) جدایه اشریشیا کولای حضور داشت. تحت واحد 26 سویه اشریشیا کولای دارای stx1 نشان دادند که 73% (19 جدایه از 26) از این جدایه‌ها برای تحت واحد stx1C مثبت بودند. از میان 21 جدایه داری ژن stx2، 8/42% (9 از 21 جدایه) از لحاظ stx2C و 1/38% (8 جدایه از 21) برای ژن stx2d مثبت بودند. آنالیز فیلوژنیک سویه‌های STEC بعد از RAPD هشت خوشه اصلی را تایید می‌کند. هر چند هیچ خوشه اختصاصی گروه سرمی مشاهده نشد. مقاومت عمدتا نسبت به اریترومایسین (5/80%)، آمیکاسین (7/52%)، سفالوتین (50%)، کانامایسین (6/41%)، نئومایسین (1/32%) و جنتامایسین (1/36%) و کمتر به نورفلوکساسین (7/2%)، انروفلوکساسین (7/2%) و سیپروفلوکساسین (7/2%) بود. مقاومت به چند دارو در 11 جدایه STEC دیده شد.}, keywords_fa = {بز,EPEC,STEC,بنگال غربی}, url = {https://ijvr.shirazu.ac.ir/article_2920.html}, eprint = {https://ijvr.shirazu.ac.ir/article_2920_5eaf3e7d3185ff7a95c732cc9c75f2a6.pdf} }